Durante los últimos días del curso, la Brigada SOS tendrá que hacer frente a los últimos incidentes antes de terminar con su primer año de instituto. El primer incidente se trata del enfrentamiento contra el archienemigo de la Brigada SOS; el presidente del Consejo Estudiantil. ¿Veremos al fin un rival a la altura de la comandante Haruhi? El segundo incidente lo traerá la segunda clienta de la Brigada SOS, que acude en busca de ayuda para resolver un extraño suceso que ocurre en su barrio: Hay un cierto lugar donde los perros y otros anímales de pronto ya no osan acercarse, y los rumores empiezan a hablan de espíritus en la zona, ¿conseguirá desvelar el misterio la Brigada SOS?